UDG 酶可催化水解含有尿嘧啶的 DNA 链的尿嘧啶碱基和糖磷酸骨架的 N-糖苷键，释放游离尿嘧啶。本酶可作用于含 dU 的单链或双链 DNA，对但对寡聚核苷酸（<6 个碱基）和 RNA 无活性。UDG 酶可用于 PCR 交叉污染控制，位点特异性突变，PCR 产物克隆以及 NGS 应用中，用于 mRNA定向测序文库的构建。防污染原理是：在 PCR 反应中以 dUTP 替代 dTTP 掺入 DNA 中，形成了含 dU 碱基的 PCR 扩增产物；UDG 酶能选择性断裂单链和双链 DNA 中 dU 碱基的糖苷键，降解含 dU 的 PCR 扩增产物。本 UDG 酶来源于大肠杆菌重组克隆表达。